A biochemical network modeled by a multiset grammar may be investigated from a dynamical viewpoint by a linear recurrence system. This interesting connection between computation by a multiset grammar and a (network) recurrent dynamics poses a minimization problem, which turns out to be NP-hard.

Minimal multiset grammars for recurrent dynamics

FARINELLI, Alessandro;FRANCO, Giuditta;RIZZI, ROMEO
2017

Abstract

A biochemical network modeled by a multiset grammar may be investigated from a dynamical viewpoint by a linear recurrence system. This interesting connection between computation by a multiset grammar and a (network) recurrent dynamics poses a minimization problem, which turns out to be NP-hard.
978-3-319-54071-9
Metabolic computing; Multiset grammar; NP-hardness; Optimization
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