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EnglishThe parsimony haplotyping problem was shown to be NP-hard when each genotype had k <= 3 ambiguous positions, while the case for k <= 2 was open. In this paper, we show that the case for k <= 2 is polynomial. and we give approximation and FPT algorithms for the general case of k >= 0 ambiguous positions.
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http://hdl.handle.net/11562/409570| Titolo: | A polynomial case of the parsimony haplotyping problem |
| Autori interni: | RIZZI, ROMEO |
| Data di pubblicazione: | 2006 |
| Rivista: | OPERATIONS RESEARCH LETTERS |
| Abstract: | The parsimony haplotyping problem was shown to be NP-hard when each genotype had k <= 3 ambiguous positions, while the case for k <= 2 was open. In this paper, we show that the case for k <= 2 is polynomial. and we give approximation and FPT algorithms for the general case of k >= 0 ambiguous positions. |
| Handle: | http://hdl.handle.net/11562/409570 |
| Appare nelle tipologie: | 01.01 Articolo in Rivista |
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