FERRARINI, Alberto
FERRARINI, Alberto
DIPARTIMENTO DI BIOTECNOLOGIE
A chromosome-anchored eggplant genome sequence reveals key events in Solanaceae evolution
2019-01-01 Barchi, Lorenzo; Pietrella, Marco; Venturini, Luca; Minio, Andrea; Toppino, Laura; Acquadro, Alberto; Andolfo, Giuseppe; Aprea, Giuseppe; Avanzato, Carla; Bassolino, Laura; Comino, Cinzia; Molin, Alessandra Dal; Ferrarini, Alberto; Maor, Louise Chappell; Portis, Ezio; Reyes-Chin-Wo, Sebastian; Rinaldi, Riccardo; Sala, Tea; Scaglione, Davide; Sonawane, Prashant; Tononi, Paola; Almekias-Siegl, Efrat; Zago, Elisa; Ercolano, Maria Raffaella; Aharoni, Asaph; Delledonne, Massimo; Giuliano, Giovanni; Lanteri, Sergio; Rotino, Giuseppe Leonardo
A patient with PMP22-related hereditary neuropathy and DBH-gene-related dysautonomia
2015-01-01 Bartoletti Stella, Anna; Chiaro, Giacomo; Calandra Buonaura, Giovanna; Contin, Manuela; Scaglione, Cesa; Barletta, Giorgio; Cecere, Annagrazia; Garagnani, Paolo; Tieri, Paolo; Ferrarini, Alberto; Piras, Silvia; Franceschi, Claudio; Delledonne, Massimo; Cortelli, Pietro; Capellari, Sabina
Ability of Bifidobacterium breve to grow on different milk types: exploring milk metabolism through genome analysis
2011-01-01 Turroni, F; Foroni, E; Serafini, F; Viappiani, A; Montanini, B; Bottacini, F; Ferrarini, Alberto; Bacchini, Pl; Rota, C; Delledonne, Massimo; Ottonello, S; van Sinderen, D; Ventura, M.
Apple fruit superficial scald resistance mediated by ethylene inhibition is associated with diverse metabolic processes
2018-01-01 Busatto, Nicola; Farneti, Brian; Commisso, Mauro; Bianconi, Martino; Iadarola, Barbara; Zago, Elisa; Ruperti, Benedetto; Spinelli, Francesco; Zanella, Angelo; Velasco, Riccardo; Ferrarini, Alberto; Chitarrini, Giulia; Vrhovsek, Urska; Delledonne, Massimo; Guzzo, Flavia; Costa, Guglielmo; Costa, Fabrizio
Application of the whole-transcriptome shotgun sequencing approach to the study of Philadelphia-positive acute lymphoblastic leukemia
2012-01-01 Iacobucci, I; Ferrarini, Alberto; Sazzini, M; Giacomelli, Enrico; Lonetti, A; Xumerle, Luciano; Ferrari, A; Papayannidis, C; Malerba, Giovanni; Luiselli, D; Boattini, A; Garagnani, P; Vitale, A; Soverini, S; Pane, F; Baccarani, M; Delledonne, Massimo; Martinelli, Giovanni
Bellerophontes: an RNA-Seq data analysis framework for chimeric transcripts discovery based on accurate fusion model
2012-01-01 F., Abate; A., Acquaviva; G., Paciello; C., Foti; E., Ficarra; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; I., Iacobucci; S., Soverini; G., Martinelli; E., Macii
Bifidobacterium asteroides PRL2011 Genome Analysis Reveals Clues for Colonization of the Insect Gut
2012-01-01 Matthias, Horn; Francesca, Bottacini; Christian, Milani; Francesca, Turroni; Borja, Sánchez; Elena, Foroni; Sabrina, Duranti; Fausta, Serafini; Alice, Viappiani; Francesco, Strati; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Bernard, Henrissat; Pedro, Coutinho; Gerald F., Fitzgerald; Abelardo, Margolles; Douwe van, Sinderen; Marco, Ventura
cDNA-AFLP analysis of plant and pathogen genes expressed in grapevine infected with Plasmopara viticola
2008-01-01 Polesani, Marianna; Desario, Filomena Antonia; Ferrarini, Alberto; Zamboni, Anita; Pezzotti, Mario; Kortekamp, A.; Polverari, Annalisa
Characterization of transcriptional complexity during berry development in Vitis vinifera using RNA-Seq
2010-01-01 Zenoni, Sara; Ferrarini, Alberto; Giacomelli, Enrico; Xumerle, Luciano; Fasoli, Marianna; Malerba, Giovanni; Bellin, Diana; Pezzotti, Mario; Delledonne, Massimo
Combining next-generation pyrosequencing with microarray for large scale expression analysis in non-model species
2009-01-01 Bellin, Diana; Ferrarini, Alberto; Chimento, Antonio; Kaiser, O; Levenkova, N; Bouffard, P; Delledonne, Massimo
De novo genome assembly of the soil-borne fungus and tomato pathogen Pyrenochaeta lycopersici
2014-01-01 Maria, Aragona; Minio, Andrea; Ferrarini, Alberto; Maria, Valente; Paolo, Bagnaresi; Luigi, Orrù; Tononi, Paola; Zamperin, Gianpiero; Alessandro, Infantino; Giampiero, Valè; Luigi, Cattivelli; Delledonne, Massimo
De novo transcriptome characterization of Vitis vinifera cv. Corvina unveils varietal diversity
2013-01-01 Venturini, Luca; Ferrarini, Alberto; Zenoni, Sara; Tornielli, Giovanni Battista; Fasoli, Marianna; DAL SANTO, Silvia; Minio, Andrea; Buson, Genny; Tononi, Paola; Zago, Elisa Debora; Zamperin, Gianpiero; Bellin, Diana; Pezzotti, Mario; Delledonne, Massimo
Deciphering bifidobacterial-mediated metabolic interactions and their impact on gut microbiota by a multi-omics approach
2016-01-01 Turroni, Francesca; Milani, Christian; Duranti, Sabrina; Mancabelli, Leonardo; Mangifesta, Marta; Viappiani, Alice; Lugli, Gabriele Andrea; Ferrario, Chiara; Gioiosa, Laura; Ferrarini, Alberto; Li, Jia; Palanza, Paola; Delledonne, Massimo; van Sinderen, Douwe; Ventura, Marco
Decreased Nucleotide and Expression Diversity and Modified Coexpression Patterns Characterize Domestication in the Common Bean.
2014-01-01 Bellucci, E; Bitocchi, E; Ferrarini, Alberto; Benazzo, A; Biagetti, E; Klie, S; Minio, Andrea; Rau, D; Rodriguez, M; Panziera, A; Venturini, Luca; Attene, G; Albertini, E; Jackson, Sa; Nanni, L; Fernie, Ar; Nikoloski, Z; Bertorelle, G; Delledonne, Massimo; Papa, R.
Detection of a rare mutation in the ferroportin gene through targeted next generation sequencing.
2016-01-01 Ferbo, L; Manzini, Pm; Badar, Sadaf; Campostrini, Natascia; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Francisci, T; Tassi, V; Valfrè, A; Dall'Omo, Am; D'Antico, S; Girelli, Domenico; Roetto, A; De Gobbi, M.
Distinct colonization patterns and cDNA-AFLP transcriptome profiles in compatible and incompatible interactions between melon and different races of Fusarium oxysporum f. sp. melonis.
2011-01-01 Sestili, S.; Polverari, Annalisa; Luongo, L.; Ferrarini, Alberto; Scotton, M.; Hussain, J.; Delledonne, Massimo; Ficcadenti, N.; Belisario, A.
DNA methylation and gene expression profiles show novel regulatory pathways in hepatocellular carcinoma
2015-01-01 Udali, Silvia; Guarini, Patrizia; Ruzzenente, Andrea; Ferrarini, Alberto; Guglielmi, Alfredo; Lotto, Valentina; Tononi, Paola; Pattini, Patrizia; Moruzzi, Sara; Campagnaro, Tommaso; Conci, Simone; Olivieri, Oliviero; Corrocher, Roberto; Delledonne, Massimo; Choi, Sang Woon; Friso, Simonetta
Early transcriptional changes in Beta vulgaris in response to low temperature
2015-01-01 Moliterni, Vita Maria Cristiana; Paris, Roberta; Onofri, Chiara; Orrù, Luigi; Cattivelli, Luigi; Pacifico, Daniela; Avanzato, Carla Giuseppina; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Mandolino, Giuseppe
Epigenetic Regulation Of Hepcidin Expression In Non-Viral Hepatocellular Carcinoma: Results Of A Genome-Wide Study
2013-01-01 Corbella, Michela; Udali, Silvia; Guarini, Patrizia; Moruzzi, Sara; Girelli, Domenico; Pattini, Patrizia; Ruzzenente, Andrea; Guglielmi, Alfredo; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Choi, S. W.; Friso, Simonetta
Evaluation of microarray sensitivity and specificity in gene expression differential analysis by RNA-Seq and quantitative RT-PCR
2014-01-01 Noel, Dd; Malerba, Giovanni; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
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| A chromosome-anchored eggplant genome sequence reveals key events in Solanaceae evolution | 1-gen-2019 | Barchi, Lorenzo; Pietrella, Marco; Venturini, Luca; Minio, Andrea; Toppino, Laura; Acquadro, Alberto; Andolfo, Giuseppe; Aprea, Giuseppe; Avanzato, Carla; Bassolino, Laura; Comino, Cinzia; Molin, Alessandra Dal; Ferrarini, Alberto; Maor, Louise Chappell; Portis, Ezio; Reyes-Chin-Wo, Sebastian; Rinaldi, Riccardo; Sala, Tea; Scaglione, Davide; Sonawane, Prashant; Tononi, Paola; Almekias-Siegl, Efrat; Zago, Elisa; Ercolano, Maria Raffaella; Aharoni, Asaph; Delledonne, Massimo; Giuliano, Giovanni; Lanteri, Sergio; Rotino, Giuseppe Leonardo | |
| A patient with PMP22-related hereditary neuropathy and DBH-gene-related dysautonomia | 1-gen-2015 | Bartoletti Stella, Anna; Chiaro, Giacomo; Calandra Buonaura, Giovanna; Contin, Manuela; Scaglione, Cesa; Barletta, Giorgio; Cecere, Annagrazia; Garagnani, Paolo; Tieri, Paolo; Ferrarini, Alberto; Piras, Silvia; Franceschi, Claudio; Delledonne, Massimo; Cortelli, Pietro; Capellari, Sabina | |
| Ability of Bifidobacterium breve to grow on different milk types: exploring milk metabolism through genome analysis | 1-gen-2011 | Turroni, F; Foroni, E; Serafini, F; Viappiani, A; Montanini, B; Bottacini, F; Ferrarini, Alberto; Bacchini, Pl; Rota, C; Delledonne, Massimo; Ottonello, S; van Sinderen, D; Ventura, M. | |
| Apple fruit superficial scald resistance mediated by ethylene inhibition is associated with diverse metabolic processes | 1-gen-2018 | Busatto, Nicola; Farneti, Brian; Commisso, Mauro; Bianconi, Martino; Iadarola, Barbara; Zago, Elisa; Ruperti, Benedetto; Spinelli, Francesco; Zanella, Angelo; Velasco, Riccardo; Ferrarini, Alberto; Chitarrini, Giulia; Vrhovsek, Urska; Delledonne, Massimo; Guzzo, Flavia; Costa, Guglielmo; Costa, Fabrizio | |
| Application of the whole-transcriptome shotgun sequencing approach to the study of Philadelphia-positive acute lymphoblastic leukemia | 1-gen-2012 | Iacobucci, I; Ferrarini, Alberto; Sazzini, M; Giacomelli, Enrico; Lonetti, A; Xumerle, Luciano; Ferrari, A; Papayannidis, C; Malerba, Giovanni; Luiselli, D; Boattini, A; Garagnani, P; Vitale, A; Soverini, S; Pane, F; Baccarani, M; Delledonne, Massimo; Martinelli, Giovanni | |
| Bellerophontes: an RNA-Seq data analysis framework for chimeric transcripts discovery based on accurate fusion model | 1-gen-2012 | F., Abate; A., Acquaviva; G., Paciello; C., Foti; E., Ficarra; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; I., Iacobucci; S., Soverini; G., Martinelli; E., Macii | |
| Bifidobacterium asteroides PRL2011 Genome Analysis Reveals Clues for Colonization of the Insect Gut | 1-gen-2012 | Matthias, Horn; Francesca, Bottacini; Christian, Milani; Francesca, Turroni; Borja, Sánchez; Elena, Foroni; Sabrina, Duranti; Fausta, Serafini; Alice, Viappiani; Francesco, Strati; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Bernard, Henrissat; Pedro, Coutinho; Gerald F., Fitzgerald; Abelardo, Margolles; Douwe van, Sinderen; Marco, Ventura | |
| cDNA-AFLP analysis of plant and pathogen genes expressed in grapevine infected with Plasmopara viticola | 1-gen-2008 | Polesani, Marianna; Desario, Filomena Antonia; Ferrarini, Alberto; Zamboni, Anita; Pezzotti, Mario; Kortekamp, A.; Polverari, Annalisa | |
| Characterization of transcriptional complexity during berry development in Vitis vinifera using RNA-Seq | 1-gen-2010 | Zenoni, Sara; Ferrarini, Alberto; Giacomelli, Enrico; Xumerle, Luciano; Fasoli, Marianna; Malerba, Giovanni; Bellin, Diana; Pezzotti, Mario; Delledonne, Massimo | |
| Combining next-generation pyrosequencing with microarray for large scale expression analysis in non-model species | 1-gen-2009 | Bellin, Diana; Ferrarini, Alberto; Chimento, Antonio; Kaiser, O; Levenkova, N; Bouffard, P; Delledonne, Massimo | |
| De novo genome assembly of the soil-borne fungus and tomato pathogen Pyrenochaeta lycopersici | 1-gen-2014 | Maria, Aragona; Minio, Andrea; Ferrarini, Alberto; Maria, Valente; Paolo, Bagnaresi; Luigi, Orrù; Tononi, Paola; Zamperin, Gianpiero; Alessandro, Infantino; Giampiero, Valè; Luigi, Cattivelli; Delledonne, Massimo | |
| De novo transcriptome characterization of Vitis vinifera cv. Corvina unveils varietal diversity | 1-gen-2013 | Venturini, Luca; Ferrarini, Alberto; Zenoni, Sara; Tornielli, Giovanni Battista; Fasoli, Marianna; DAL SANTO, Silvia; Minio, Andrea; Buson, Genny; Tononi, Paola; Zago, Elisa Debora; Zamperin, Gianpiero; Bellin, Diana; Pezzotti, Mario; Delledonne, Massimo | |
| Deciphering bifidobacterial-mediated metabolic interactions and their impact on gut microbiota by a multi-omics approach | 1-gen-2016 | Turroni, Francesca; Milani, Christian; Duranti, Sabrina; Mancabelli, Leonardo; Mangifesta, Marta; Viappiani, Alice; Lugli, Gabriele Andrea; Ferrario, Chiara; Gioiosa, Laura; Ferrarini, Alberto; Li, Jia; Palanza, Paola; Delledonne, Massimo; van Sinderen, Douwe; Ventura, Marco | |
| Decreased Nucleotide and Expression Diversity and Modified Coexpression Patterns Characterize Domestication in the Common Bean. | 1-gen-2014 | Bellucci, E; Bitocchi, E; Ferrarini, Alberto; Benazzo, A; Biagetti, E; Klie, S; Minio, Andrea; Rau, D; Rodriguez, M; Panziera, A; Venturini, Luca; Attene, G; Albertini, E; Jackson, Sa; Nanni, L; Fernie, Ar; Nikoloski, Z; Bertorelle, G; Delledonne, Massimo; Papa, R. | |
| Detection of a rare mutation in the ferroportin gene through targeted next generation sequencing. | 1-gen-2016 | Ferbo, L; Manzini, Pm; Badar, Sadaf; Campostrini, Natascia; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Francisci, T; Tassi, V; Valfrè, A; Dall'Omo, Am; D'Antico, S; Girelli, Domenico; Roetto, A; De Gobbi, M. | |
| Distinct colonization patterns and cDNA-AFLP transcriptome profiles in compatible and incompatible interactions between melon and different races of Fusarium oxysporum f. sp. melonis. | 1-gen-2011 | Sestili, S.; Polverari, Annalisa; Luongo, L.; Ferrarini, Alberto; Scotton, M.; Hussain, J.; Delledonne, Massimo; Ficcadenti, N.; Belisario, A. | |
| DNA methylation and gene expression profiles show novel regulatory pathways in hepatocellular carcinoma | 1-gen-2015 | Udali, Silvia; Guarini, Patrizia; Ruzzenente, Andrea; Ferrarini, Alberto; Guglielmi, Alfredo; Lotto, Valentina; Tononi, Paola; Pattini, Patrizia; Moruzzi, Sara; Campagnaro, Tommaso; Conci, Simone; Olivieri, Oliviero; Corrocher, Roberto; Delledonne, Massimo; Choi, Sang Woon; Friso, Simonetta | |
| Early transcriptional changes in Beta vulgaris in response to low temperature | 1-gen-2015 | Moliterni, Vita Maria Cristiana; Paris, Roberta; Onofri, Chiara; Orrù, Luigi; Cattivelli, Luigi; Pacifico, Daniela; Avanzato, Carla Giuseppina; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Mandolino, Giuseppe | |
| Epigenetic Regulation Of Hepcidin Expression In Non-Viral Hepatocellular Carcinoma: Results Of A Genome-Wide Study | 1-gen-2013 | Corbella, Michela; Udali, Silvia; Guarini, Patrizia; Moruzzi, Sara; Girelli, Domenico; Pattini, Patrizia; Ruzzenente, Andrea; Guglielmi, Alfredo; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Choi, S. W.; Friso, Simonetta | |
| Evaluation of microarray sensitivity and specificity in gene expression differential analysis by RNA-Seq and quantitative RT-PCR | 1-gen-2014 | Noel, Dd; Malerba, Giovanni; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo |