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PASS-bis: a bisulfite aligner suitable for whole methylome analysis of Illumina and SOLiD reads 1-gen-2013 Campagna, Davide; Telatin, Andrea; Forcato, Claudio; Vitulo, Nicola; Valle, Giorgio
ZASP interacts with the mechanosensing protein Ankrd2 and p53 in the signalling network of striated muscle 1-gen-2014 Martinelli, Valentina C; Kyle, W. Buck; Kojic, Snezana; Vitulo, Nicola; Li, Zhaohui; Belgrano, Anna; Maiuri, Paolo; Banks, Lawrence; Vatta, Matteo; Valle, Giorgio; Faulkner, Georgine
Chromosome scale genome assembly and transcriptome profiling of Nannochloropsis gaditana in nitrogen depletion 1-gen-2014 Corteggiani Carpinelli, Elisa; Telatin, Andrea; Vitulo, Nicola; Forcato, Claudio; D'Angelo, Michela; Schiavon, Riccardo; Vezzi, Alessandro; Giacometti, Giorgio Mario; Morosinotto, Tomas; Valle, Giorgio
Ecotype diversity and conversion in Photobacterium profundum strains 1-gen-2014 Lauro, Federico M; Eloe Fadrosh, Emiley A; Richter, Taylor K. S; Vitulo, Nicola; Ferriera, Steven; Johnson, Justin H; Bartlett, Douglas H.
A deep survey of alternative splicing in grape reveals changes in the splicing machinery related to tissue, stress condition and genotype 1-gen-2014 Vitulo, Nicola; Forcato, Claudio; Carpinelli, Elisa Corteggiani; Telatin, Andrea; Campagna, Davide; D'Angelo, Michela; Zimbello, Rosanna; Corso, Massimiliano; Vannozzi, Alessandro; Bonghi, Claudio; Lucchin, Margherita; Valle, Giorgio
SATRAP: SOLiD Assembler TRAnslation Program 1-gen-2015 Campagna, Davide; Gasparini, Fabio; Franchi, Nicola; Manni, Lucia; Telatin, Andrea; Vitulo, Nicola; Ballarin, Loriano; Valle, Giorgio
Profiling of skeletal muscle Ankrd2 protein in human cardiac tissue and neonatal rat cardiomyocytes 1-gen-2015 Jasnic Savovic, Jovana; Nestorovic, Aleksandra; Savic, Slobodan; Karasek, Sinisa; Vitulo, Nicola; Valle, Giorgio; Faulkner, Georgine; Radojkovic, Dragica; Kojic, Snezana
Physical Mapping of Bread Wheat Chromosome 5A: An Integrated Approach 1-gen-2015 Barabaschi, Delfina; Magni, Federica; Volante, Andrea; Gadaleta, Agata; Šimková, Hana; Scalabrin, Simone; Prazzoli, Maria Lucia; Bagnaresi, Paolo; Lacrima, Katia; Michelotti, Vania; Desiderio, Francesca; Orrù, Luigi; Mazzamurro, Valentina; Fricano, Agostino; Mastrangelo, Annamaria; Tononi, Paola; Vitulo, Nicola; Jurman, Irena; Frenkel, Zeev; Cattonaro, Federica; Morgante, Michele; Blanco, Antonio; Doležel, Jaroslav; Delledonne, Massimo; Stanca, Antonio M.; Cattivelli, Luigi; Valè, Giampiero
Comprehensive transcript profiling of two grapevine rootstock genotypes contrasting in drought susceptibility links the phenylpropanoid pathway to enhanced tolerance 1-gen-2015 Corso, Massimiliano; Vannozzi, Alessandro; Maza, Elie; Vitulo, Nicola; Meggio, Franco; Pitacco, Andrea; Telatin, Andrea; D'Angelo, Michela; Feltrin, Erika; Negri, Alfredo Simone; Prinsi, Bhakti; Valle, Giorgio; Ramina, Angelo; Bouzayen, Mondher; Bonghi, Claudio; Lucchin, Margherita
Transcriptome dynamics in the asexual cycle of the chordate Botryllus schlosseri 1-gen-2016 Campagna, Davide; Gasparini, Fabio; Franchi, Nicola; Vitulo, Nicola; Ballin, Francesca; Manni, Lucia; Valle, Giorgio; Ballarin, Loriano
Grapevine Rootstocks Differentially Affect the Rate of Ripening and Modulate Auxin-Related Genes in Cabernet Sauvignon Berries 1-gen-2016 Corso, Massimiliano; Vannozzi, Alessandro; Ziliotto, Fiorenza; Zouine, Mohamed; Maza, Elie; Nicolato, Tommaso; Vitulo, Nicola; Meggio, Franco; Valle, Giorgio; Bouzayen, Mondher; Müller, Maren; Munné Bosch, Sergi; Lucchin, Margherita; Bonghi, Claudio
Direct 16S rRNA-seq from bacterial communities: a PCR-independent approach to simultaneously assess microbial diversity and functional activity potential of each taxon 1-gen-2016 Rosselli, Riccardo; Romoli, Ottavia; Vitulo, Nicola; Vezzi, Alessandro; Campanaro, Stefano; de Pascale, Fabio; Schiavon, Riccardo; Tiarca, Maurizio; Poletto, Fabio; Concheri, Giuseppe; Valle, Giorgio; Squartini, Andrea
Light Remodels Lipid Biosynthesis in Nannochloropsis gaditana by Modulating Carbon Partitioning between Organelles 1-gen-2016 Alboresi, Alessandro; Perin, Giorgio; Vitulo, Nicola; Diretto, Gianfranco; Block, Maryse; Jouhet, Juliette; Meneghesso, Andrea; Valle, Giorgio; Giuliano, Giovanni; Maréchal, Eric; Morosinotto, Tomas
Transcriptome pathways in leaf and root of grapevine genotypes with contrasting drought tolerance 1-gen-2016 Corso, M.; Vannozzi, A.; Maza, E.; Vitulo, Nicola; Meggio, F.; Bouzayen, M.; Valle, G.; Bonghi, C.; Lucchin, M.
BIOCHEMICAL AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF THE BACTERIAL PsaR1 SENSOR IN THE PSEUDOMONAS SYRINGAE PV. ACTINIDIAE-KIWIFRUIT INTERACTION 1-gen-2017 Vallone, R.; Foresti, Chiara; Regaiolo, A.; Colombo, Teresa; Vitulo, N.; Astegno, A.; Venturi, V.; Crimi, M.; Polverari, A.; Vandelle, E.
Transcriptional Characterization of a Widely-Used Grapevine Rootstock Genotype under Different Iron-Limited Conditions 1-gen-2017 Vannozzi, Alessandro; Donnini, Silvia; Vigani, Gianpiero; Corso, Massimiliano; Valle, Giorgio; Vitulo, Nicola; Bonghi, Claudio; Zocchi, Graziano; Lucchin, Margherita
Fast genetic identification of the Beluga sturgeon and its sought-after caviar to stem illegal trade 1-gen-2017 Boscari, Elisa; Vitulo, Nicola; Ludwig, Arne; Caruso, Chiara; Mugue, Nikolai S.; Suciu, Radu; Onara, Dalia F.; Papetti, Chiara; Marino, Ilaria A. M.; Zane, Lorenzo; Congiu, Leonardo
QueryOR: a comprehensive web platform for genetic variant analysis and prioritization 1-gen-2017 Bertoldi, Loris; Forcato, Claudio; Vitulo, Nicola; Birolo, Giovanni; De Pascale, Fabio; Feltrin, Erika; Schiavon, Riccardo; Anglani, Franca; Negrisolo, Susanna; Zanetti, Alessandra; D'Avanzo, Francesca; Tomanin, Rosella; Faulkner, Georgine; Vezzi, Alessandro; Valle, Giorgio
Downregulation of lizard immuno-genes in the regenerating tail and myogenes in the scarring limb suggests that tail regeneration occurs in an immuno-privileged organ 1-gen-2017 Vitulo, Nicola; Dalla Valle, Luisa; Skobo, Tatjana; Valle, Giorgio; Alibardi, Lorenzo
Genome-Wide Transcriptional Changes and Lipid Profile Modifications Induced by Medicago truncatula N5 Overexpression at an Early Stage of the Symbiotic Interaction with Sinorhizobium meliloti. 1-gen-2017 Santi, C; Molesini, B; Guzzo, F; Pii, Y; Vitulo, N; Pandolfini, T.
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