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Assembling the Diversity: Variety-Specific Reconstruction and Characterization of Berries Transcriptome in Vitis vinifera cv. Corvina 1-gen-2012 Venturini, Luca; Alberto, Ferrarini; Minio, Andrea; Genny, Buson; Pezzotti, Mario; Zenoni, Sara; Fasoli, Marianna; Delledonne, Massimo
The high polyphenol content of grapevine cultivar tannat berries is conferred primarily by genes that are not shared with the reference genome. 1-gen-2013 Da Silva, C; Zamperin, Gianpiero; Ferrarini, Alberto; Minio, Andrea; Dal Molin, Alessandra; Venturini, Luca; Buson, Genny; Tononi, Paola; Avanzato, Carla Giuseppina; Zago, Elisa Debora; Boido, E; Dellacassa, E; Gaggero, C; Pezzotti, Mario; Carrau, F; Delledonne, Massimo
RNA-Seq analysis discloses early senescence and nucleolar dysfunction triggered by Tdp1  depletion in Medicago truncatula 1-gen-2013 M., Dona; M., Confalonieri; Minio, Andrea; M., Biggiogera; A., Buttafava; E., Raimondi; Delledonne, Massimo; L., Ventura; M. E., Sabatini; A., Macovei; G., Giraffa; D., Carbonera; A., Balestrazzi
De novo transcriptome characterization of Vitis vinifera cv. Corvina unveils varietal diversity 1-gen-2013 Venturini, Luca; Ferrarini, Alberto; Zenoni, Sara; Tornielli, Giovanni Battista; Fasoli, Marianna; DAL SANTO, Silvia; Minio, Andrea; Buson, Genny; Tononi, Paola; Zago, Elisa Debora; Zamperin, Gianpiero; Bellin, Diana; Pezzotti, Mario; Delledonne, Massimo
Curtobacterium sp. Genome Sequencing Underlines Plant Growth Promotion-Related Traits 1-gen-2014 D., Bulgari; Minio, Andrea; P., Casati; F., Quaglino; Delledonne, Massimo; P. A., Bianco
Decreased Nucleotide and Expression Diversity and Modified Coexpression Patterns Characterize Domestication in the Common Bean. 1-gen-2014 Bellucci, E; Bitocchi, E; Ferrarini, Alberto; Benazzo, A; Biagetti, E; Klie, S; Minio, Andrea; Rau, D; Rodriguez, M; Panziera, A; Venturini, Luca; Attene, G; Albertini, E; Jackson, Sa; Nanni, L; Fernie, Ar; Nikoloski, Z; Bertorelle, G; Delledonne, Massimo; Papa, R.
De novo genome assembly of the soil-borne fungus and tomato pathogen Pyrenochaeta lycopersici 1-gen-2014 Maria, Aragona; Minio, Andrea; Ferrarini, Alberto; Maria, Valente; Paolo, Bagnaresi; Luigi, Orrù; Tononi, Paola; Zamperin, Gianpiero; Alessandro, Infantino; Giampiero, Valè; Luigi, Cattivelli; Delledonne, Massimo
Analisi bioinformatica di genomi e di trascrittomi utilizzando dati ottenuti con tecnologia Next Generation Sequencing 1-gen-2015 Minio, Andrea
Genome Assembly With 2nd Generation Sequencing Technologies: Definition of Best Experimental Design In Relation To Genomic Features 1-gen-2015 Minio, Andrea
Depletion of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1α (MtTdp1α) affects transposon expression in Medicago truncatula 1-gen-2016 Sabatini, Maria Elisa; Donà, Mattia; Leonetti, Paola; Minio, Andrea; Delledonne, Massimo; Carboneral, Daniela; Confalonieri, Massimo; Giraffa, Giorgio; Balestrazzi, Alma
Whole-genome sequencing and SNV genotyping of 'Nebbiolo' (Vitis vinifera L.) clones 1-gen-2017 Gambino, Giorgio; Dal Molin, Alessandra; Boccacci, Paolo; Minio, Andrea; Chitarra, Walter; Avanzato, Carla Giuseppina; Tononi, Paola; Perrone, Irene; Raimondi, Stefano; Schneider, Anna; Pezzotti, Mario; Mannini, Franco; Gribaudo, Ivana; Delledonne, Massimo
MtTdp1?-depleted Medicago truncatula plants show reduced cuticle permeability and altered expression of defense genes 1-gen-2017 Don(`a), M.; Sabatini, M. E.; Biggiogera, M.; Confalonieri, M.; Minio, A.; Delledonne, M.; Giraffa, G.; Carbonera, D.; Araujo, S.; Balestrazzi, A.
Grapevine Grafting: Scion Transcript Profiling and Defense-Related Metabolites Induced by Rootstocks 1-gen-2017 Chitarra, Walter; Perrone, Irene; Avanzato, Carla G; Minio, Andrea; Boccacci, Paolo; Santini, Deborah; Gilardi, Giovanna; Siciliano, Ilenia; Gullino, Maria L; Delledonne, Massimo; Mannini, Franco; Gambino, Giorgio
Unraveling the complexity of transcriptomic, metabolomic and quality environmental response of tomato fruit 1-gen-2017 D'Esposito, Daniela; Ferriello, Francesca; Molin, Alessandra Dal; Diretto, Gianfranco; Sacco, Adriana; Minio, Andrea; Barone, Amalia; Di Monaco, Rossella; Cavella, Silvana; Tardella, Luca; Giuliano, Giovanni; Delledonne, Massimo; Frusciante, Luigi; Ercolano, Maria Raffaella
The genome assembly of the fungal pathogen Pyrenochaeta lycopersici from Single-Molecule Real-Time sequencing sheds new light on its biological complexity 1-gen-2018 Dal Molin, Alessandra; Minio, Andrea; Griggio, Francesca; Delledonne, Massimo; Infantino, Alessandro; Aragona, Maria
A chromosome-anchored eggplant genome sequence reveals key events in Solanaceae evolution 1-gen-2019 Barchi, Lorenzo; Pietrella, Marco; Venturini, Luca; Minio, Andrea; Toppino, Laura; Acquadro, Alberto; Andolfo, Giuseppe; Aprea, Giuseppe; Avanzato, Carla; Bassolino, Laura; Comino, Cinzia; Molin, Alessandra Dal; Ferrarini, Alberto; Maor, Louise Chappell; Portis, Ezio; Reyes-Chin-Wo, Sebastian; Rinaldi, Riccardo; Sala, Tea; Scaglione, Davide; Sonawane, Prashant; Tononi, Paola; Almekias-Siegl, Efrat; Zago, Elisa; Ercolano, Maria Raffaella; Aharoni, Asaph; Delledonne, Massimo; Giuliano, Giovanni; Lanteri, Sergio; Rotino, Giuseppe Leonardo
The genetic basis of sex determination in grapes 1-gen-2020 Massonnet, M('(e))lanie; Cochetel, No('(e)); Minio, Andrea; Vondras, Amanda M.; Lin, Jerry; Muyle, Aline; Garcia, Jadran F.; Zhou, Yongfeng; Delledonne, Massimo; Riaz, Summaira; Figueroa-Balderas, Rosa; Gaut, Brandon S.; Cantu, Dario
?Nebbiolo? genome assembly allows surveying the occurrence and functional implications of genomic structural variations in grapevines (Vitis vinifera L.) 1-gen-2022 Maestri, S.; Gambino, G.; Lopatriello, G.; Minio, A.; Perrone, I.; Cosentino, E.; Giovannone, B.; Marcolungo, L.; Alfano, M.; Rombauts, S.; Cantu, D.; Rossato, M.; Delledonne, M.; Calder('o)n, L.
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